Au lendemain de la Grande Guerre, le "Southern Methodist Centenary Movement" américain organisa une assistance matérielle aux habitants des régions dévastées de Belgique. Cette oeuvre ne tarda pas à s'occuper d'évangélisation. En 1922, la "Methodist Episcopal Church, South" organisa une "Belgian Mission" à Bruxelles, qui prit le statut d'a.s.b.l. en 1923. Elle lança plusieurs publications et ouvrit une clinique, une école secondaire et une "maison du protestantisme belge" : le Foyer Fraternel. Le développement de cette Mission aboutit en 1930 à l'organisation de la "Belgian Annual Conference", regroupant une vingtaine d'églises locales et animée par le surintendnat William Thonger. En 1939, cette Conférence annuelle belge de l'Église méthodiste fut rattachée au diocèse de genève. En 1952, elle disposait de 21 prédicateurs itinérants, huit prédicateurs locaux, 17 chargés d'églises (pour 25 paroisses), 3410 membres et quatre institutions. En 1964, un comité de liaison fut créé avec l'Église Évangélique Protestante de Belgique en vue d'ériger une Église unie. En décembre 1969, l'Église Évangélique Protestante de Belgique et l'Église méthodiste s'unirent et formèrent l'Église Protestante de Belgique.