Pour les protestants, l'Église locale est pleinement Église de Jésus-Christ : c'est principalement au sein de cette communauté de croyants, propre à une époque et à un lieu donné, rassemblée autour de la Parole et des sacrements, que les fidèles vivent leur foi- même si l'Église locale ne vit pas en autarcie et est solidaire des autres communautés. C'est dire l'importance que revêtent les archives des paroisses pour appréhender le protestantisme dans toute sa richesse et sa diversité. 
Il n'entre pas dans la vocation des archives synodales de rassembler les archives de paroisses. Mais au fil des décénnies, il en a accumulé un certain nombre. En définitive, ce sont pas moins de 19 paroisses existantes ou supprimées dont on a retrouvé des archives, mêlées aux archives synodales. L'ampleur des archives conservées pour chaque paroisse est très variable. dans la plupart des cas, on n'a retrouvé que quelques documents. Ce n'est que pour quatre paroisses - Ixelles (Sint Andrew's Church of Scotland), Gand, Herstal et Nessonvaux- que l'on a retrouvé des lots plus conséquents.